Met het goedkoper worden van nieuwe technieken om breed genetische diagnostiek in te zetten, neemt ook de inzetbaarheid daarvan toe. Eind 2018 werd in het NTvG een overzicht gegeven van de voor- en nadelen van ‘whole exome sequencing’, een techniek waarbij het volledige eiwit-coderende deel van het DNA wordt geanalyseerd.1 Hiermee kan breder worden gezocht naar een mogelijk onderliggende genetische afwijking bij een patiënt met een onbekend ziektebeeld en verdenking op een monogenetische aandoening. Voorheen moest op basis van een anamnestisch gegeven, symptoom of klinische bevinding een specifieke genanalyse worden aangevraagd en vervolgens werd alleen dat ene gen geanalyseerd. Tegenwoordig kan breed worden gekeken naar een verzameling van genen die betrokken zijn bij het symptoom of de klinische bevinding – zogenoemde genpanels – of kan het complete exoom of genoom worden geanalyseerd. Dat kan wenselijk zijn als eerdere testen geen afwijkingen opleverden, maar de verdenking op een genetisch bepaalde…
‘Whole exome sequencing’ en ‘whole genome sequencing’ bij ziekte zonder diagnose
Whole exome sequencing and whole genome sequencing (WES/WGS) as a diagnostic tool has become more readily available. A recent study on the diagnostic yield in a highly selected patient population with undiagnosed disease has demonstrated the power of a stringent diagnostic process that includes WES/WGS. Up to one third of patients received a diagnosis, following critical clinical review of tests performed previously, additional targeted biochemical or genetic diagnostic tests and/or the application of WES/WGS. In more than 60% of the resolved cases, WES or WGS played a crucial role. The success of the Undiagnosed Disease Network relies strongly on patient selection, review of clinical symptoms and medical records by a team of specialists, and close collaboration with basic scientists and laboratories to study the clinical impact of possible genetic variations and mutations that are discovered through WES/WGS. Although the results are impressive, it remains to be determined whether such a dedicated approach is feasible in a non-research setting.
Conflict of interest and financial support: potential conflicts of interest have been reported for this article. ICMJE forms provided by the authors are available online along with the full text of this article.
Reacties